机械学习理论に基づく免疫状态の推定と理解

1.2 データサイエンス
3.5 生物学
3.7 医歯薬学

小林徹也

生产技术研究所

教授

免疫は未知で多様な外敵を認識?学習し、速やかに外敵を排除する生体防御システムです。免疫による外敵の認識?学習において、T細胞?B細胞をはじめとした免疫細胞の多様性(レパートリー)とその変化が重要な役割を果たします。我々は、免疫細胞集団を対象として、集団ダイナミクスモデルや学習理論にハイスループットシーケンシングに基づく免疫レパートリー解析を統合することで、我々の免疫状態の動的な維持?制御に関わる原理の理解と免疫状態のデータからの推定に取り組んでいます。

プロジェクトに関する鲍搁尝

共同実施者

理化学研究所生命医科学研究センター免疫恒常性研究チーム

主な関连论文

Ryo Yokota, Yuki Kaminaga and Tetsuya J. Kobayashi, Quantification of Inter-Sample Differences in T-Cell Receptor Repertoires Using Sequence-Based Information, Front. Immunol., doi: 10.3389/fimmu.2017.01500, 2017.11,
Kazumasa B. Kaneko, Ryosuke Tateishi, Takahisa Miyao, Yuki Takakura, Nobuko Akiyama, Ryo Yokota, Taishin Akiyama & Tetsuya J. Kobayashi, Quantitative analysis reveals reciprocal regulations underlying recovery dynamics of thymocytes and thymic environment in mice, Communications Biology, volume 2, Article number: 444, doi: 10.1038/s42003-019-0688-8, 2019,
Takuya Kato and Tetsuya J. Kobayashi, Understanding adaptive immune system as reinforcement learning, Phys. Rev. Research 3, 013222, doi: 10.1103/PhysRevResearch.3.013222, 2021.3,